科技型中小企业技术创新基金从1999年起开始实施，主要用于支持中小企业具有自主知识产权的技术创新项目和科技孵化器建设。该科技专项基金自设立以来，全区共有113个项目获得国家资助，资金总额达到6745万元，自治区也投入700多万元资助中小企业技术创新。9年来，承担国家和自治区两级技术创新基金项目的企业累计实现销售收入超过25亿元，上缴税金近3亿元，已经成为全区科技型中小企业发展的领头羊，对全区新经济增长点的形成发挥着重要作用。

　　科技风险基金从2000年起开始实施，累积规模已经超过1亿元，先后支持十几家企业的46个高新技术产业化项目，实现产值11.37亿元、利税1.69亿元。在促进企业技术创新的同时，科技风险基金还引导产业布局，吸引了民间资本。

　　科技发展创新引导奖励专项基金是2007年新设立的科技专项基金，规模已经达到1.1亿元，由自治区财政拨款，主要用于引导形成拥有自主知识产权、自主品牌和持续创新能力的新型企业，增强全区战略新兴产业的原始创新能力和重点领域的集成创新能力。2007年，全区有30多家企业得到引导奖励专项基金的支持。