该实施办法分为总则、知识产权备案、依申请扣留、依职权调查处理、货物处置和费用和附则，共6章43条。该实施办法明确，海关将参照本办法对世界博览会标志实施保护。2004年5月25日海关总署令第114号公布的《中华人民共和国海关关于〈中华人民共和国知识产权海关保护条例〉的实施办法》同时废止。